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Population analysis of vitamin D receptor polymorphisms and the role of genetic ancestry in an admixed population Genet. Mol. Biol.
Lins,Tulio C.; Vieira,Rodrigo G.; Grattapaglia,Dario; Pereira,Rinaldo W..
The vitamin D receptor (VDR) is an essential protein related to bone metabolism. Some VDR alleles are differentially distributed among ethnic populations and display variable patterns of linkage disequilibrium (LD). In this study, 200 unrelated Brazilians were genotyped using 21 VDR single nucleotide polymorphisms (SNPs) and 28 ancestry informative markers. The patterns of LD and haplotype distribution were compared among Brazilian and the HapMap populations of African (YRI), European (CEU) and Asian (JPT+CHB) origins. Conditional regression and haplotype-specific analysis were performed using estimates of individual genetic ancestry in Brazilians as a quantitative trait. Similar patterns of LD were observed in the 5' and 3' gene regions. However, the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Brazilian population; HapMap; Haplotype; Population diversity; VDR.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572011000300003
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Potencial de híbridos entre clones-elite de eucalipto por meio de marcadores microssatélites PAB
Aguiar,Marcelo Sfeir de; Ferreira,Daniel Furtado; Aguiar,Aurélio Mendes; Bison,Odair; Rezende,Gabriel Dehon Sampaio Peçanha; Grattapaglia,Dario.
O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial dos marcadores microssatélites em predizer o comportamento dos híbridos entre clones-elite de eucalipto da empresa Aracruz Celulose. Foram utilizados 21 clones-elite, cruzados conforme o esquema de dialelo balanceado. Os 137 híbridos obtidos, além dos 21 pais e 11 híbridos repetidos, foram avaliados em três locais: Aracruz, São Mateus e Caravelas, em delineamento de blocos incompletos 13x13 com 40 repetições. As parcelas foram constituídas de uma planta, espaçadas 3x3 m. Os caracteres circunferência à altura do peito (CAP) e densidade básica da madeira foram avaliados aos dois anos de idade. Os dados foram submetidos à análise dialélica e, posteriormente, foi obtida a correlação entre a divergência genética...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Eucalyptus; Análise dialelo; Divergência genética; Melhoramento genético.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000700013
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Variabilidade no cpDNA em Manilkara huberi, espécie sob manejo sustentável na Amazônia brasileira PAB
Azevedo,Vânia Cristina Rennó; Kanashiro,Milton; Grattapaglia,Dario; Ciampi,Ana Yamaguishi.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a existência de estruturação genética matrilinear em maçaranduba (Manilkara huberi). Foram avaliados 481 indivíduos adultos de M. huberi, distribuídos em 200 hectares de uma população natural na Floresta Nacional do Tapajós, Belterra, PA, e 88 regenerantes, com base na análise de nove microssatélites de cloroplasto e, de 96 indivíduos adultos, selecionados aleatoriamente na área de 200 ha, foi realizado o seqüenciamento de três regiões não codificadoras de cpDNA. Não foi detectado polimorfismo de seqüência. A análise da variabilidade haplotípica mostrou polimorfismo relativamente limitado, que resultou em 15 haplótipos, com diversidade genética total (hT) de 0,898. Foi detectada a existência de estruturação genética...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Conservação; Estruturação genética espacial; Maçaranduba; Manejo; Microssatélite; Seqüenciamento.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000700010
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